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性取向的形成是生物、心理、社会多重因素共同作用的结果，主要与遗传基因、激素水平、大脑结构、童年经历及社会环境等因素有关。
双生子研究表明同卵双胞胎性取向一致性显著高于异卵双胞胎，全基因组关联分析已发现X染色体q28区域、13号染色体等位点与性取向存在关联。遗传因素可能通过影响胎儿期神经发育通路发挥作用，但尚未发现单一决定性基因。
胎儿期雄激素暴露水平可能影响性别认同与性取向发展。男性化不足的男胎与雄化过度的女胎，成年后出现非典型性取向的概率更高。产前应激导致的母体糖皮质激素升高也可能改变胎儿下丘脑性分化中枢的发育。
同性恋者大脑前连合、视交叉上核等结构的形态特征更接近异性生理性别。下丘脑INAH3核团体积差异、杏仁核功能连接模式等神经生物学特征，可能与性取向的先天性基础相关。
精神分析理论曾提出"亲子关系决定论"，但现代研究证实童年经历并非主因。性别非典型行为如男孩偏爱洋娃娃可能反映先天倾向而非后天塑造，多数性少数者在传统教养环境中仍形成稳定取向。
文化宽容度影响性取向表达而非本质。跨文化研究显示，尽管不同社会对同性关系的接纳程度差异巨大，但各文化中同性吸引者的比例保持稳定，说明社会环境主要影响个体是否公开取向。
目前科学界共识认为性取向是先天因素主导的连续谱现象，建议通过均衡饮食维持神经递质平衡，规律运动缓解压力，避免酒精等神经毒性物质。家长应尊重青少年性别表达多样性，学校需提供包容的性教育环境。若因性取向出现持续心理困扰，可寻求专业心理咨询而非试图"矫正"，任何强制改变性取向的干预措施均缺乏科学依据且违反伦理。
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