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非细菌性前列腺炎的病因尚不肯定，沙眼衣原体是否是致病因素存在争议。但男性40％非淋菌性尿道炎和35岁以下多数急性附睾炎均因沙眼衣原体感染引起。支原体在非菌性非衣原体性尿道炎患者尿道中数量远远大于在衣原体性尿道炎者尿道中的数量，且用针对支原体的抗生素(对衣原体无效)治疗效果好。
因此，沙眼衣原体和支原体可能是非细菌性前列腺炎的病因。衣原体和支原体感染与不育的关系目前也不明确，有待于进一步研究。病毒、真菌、厌氧菌也可能是非细菌性前列腺炎的病因。
非细菌性前列腺炎的症状表现与细菌性前列腺炎基本相似。可出现腰背部、耻骨上区钝痛或不同程度压迫感；外生殖器、会阴或肛门部胀痛或不适；可有尿频、尿急、尿痛、夜尿多；大便或排尿终末可有白色分泌物自尿道口滴出；全身出现乏力、倦怠以及多种神经衰弱症状；可伴有勃起功能障碍、早泄等性功能障碍；肛诊前列腺可有肿胀，轻压痛；化验前列腺按摩液自细胞和含有脂肪的巨噬细胞较正常多，但前列腺液细菌培养阴性。对前列腺液进行衣原体和支原体的脱氧核糖核酸聚合酶链式反应，可能呈阳性结果。
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