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支原体阳性可能引发呼吸道感染、泌尿生殖系统炎症、关节炎、皮肤病变及新生儿并发症等疾病。
支原体肺炎是最常见表现，病原体通过飞沫传播侵袭呼吸道黏膜，典型症状包括顽固性干咳、低热和胸痛。治疗采用大环内酯类抗生素如阿奇霉素、克拉霉素，或四环素类如多西环素，疗程通常14天。重症需联合糖皮质激素缓解免疫反应。
解脲支原体感染尿道或生殖道后，男性易发非淋菌性尿道炎，表现为尿痛和分泌物；女性可能引发宫颈炎和盆腔炎。推荐使用交沙霉素联合多西环素治疗，性伴侣需同步治疗。反复感染需检测耐药性并调整方案。
支原体抗原与人体关节组织存在交叉反应，约5%感染者会出现膝关节、踝关节肿痛。除抗生素治疗外，可选用非甾体抗炎药如塞来昔布缓解症状，严重者需关节腔注射糖皮质激素。
少数患者出现多形红斑或Stevens-Johnson综合征，与免疫复合物沉积有关。除病原治疗外，皮肤科会诊建议使用抗组胺药氯雷他定，重症需静脉注射免疫球蛋白保护表皮。
孕妇感染可能导致绒毛膜羊膜炎、早产或新生儿肺炎。孕中期确诊需选用红霉素或阿奇霉素治疗，避免使用氟喹诺酮类。新生儿感染需住院接受静脉抗生素治疗并监测肺功能。
支原体阳性患者应增加富含维生素A的胡萝卜、菠菜以修复黏膜，适度进行太极拳等温和运动增强免疫力。日常需单独使用毛巾避免交叉感染，治疗期间禁止性生活。定期复查PCR检测直至转阴，合并基础疾病者需每3个月随访。出现持续发热或血尿症状应立即就医。
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