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首先，要明白什么是精子的畸形率。精子的畸形率检测是精液化验的很重要的一部分，是精子经过特殊染色显露头部、身躯及尾巴之后，经过检验人员与标准的正常精子图谱比对之后，计算出的不正常精子（包括头部、颈部、躯干及尾巴）不正常精子的比例。一般要计数10个显微镜视野，总数200个以上。WHO分类的畸形精子分为头部畸形缺陷，颈部、中断和尾部畸形，胞浆小体异常等。第4版WHO工作手册正常形态要至少占15％；第5版WHO工作手册中，正常形态至少占4％（诊断标准有差别）。
但第五版的教材中没有亚洲人的正常数据，因此，多数生殖中心仍然参考第四版的标准。
那么什么原因会导致精子畸形呢？一方面，由于睾丸“生精”工厂批量生成精子的数量之多，有些次品（畸形精子）也是可以理解的，另一方面，精子自身的生成过程比较复杂，使得其对外界环境不良因素的刺激非常敏感，适应能力比较差，从而使得很多精子在生成和成熟过程中发生了变化，导致精子畸形，这个恰恰是比较重要的一点，精子的这种对外界刺激的不敏感是一把“双刃剑”，好处就是使得遗传物质比较稳定，维持了人类雄性基因的持续性，不利之处就是比较迟钝，稍微受到一点不良的刺激如，吸烟，酗酒，辐射等都会发生不良的变化。基于这一点，导致精子畸形的很多原因包括如下几点：
一、泌尿生殖系感染：如衣原体感染、细菌感染导致的尿道炎，附睾炎，前列腺炎等，会导致精子的产生及成熟过程发生障碍，会影响到生精微环境很多细胞因子的分泌，导致精子畸形，进而男性不育。
二、解剖结构异常：常见的是精索静脉曲张，尤其是重度的曲张，导致睾丸局部温度升高，缺血淤氧导致代谢活性产物的蓄积，脂质过氧化，导致过度畸形精子的产生。
三、不良的生活方式和环境的影响：事实上，男性精子的质量呈现下降的趋势，是世界范围内达成的共识。工业化的影响，竞争和工作压力的加剧，吸烟、雾霾、环境洗涤剂等雌激素类物质、重金属污染、电离辐射包括电脑、手机、无线网络等的影响，运动减少或缺乏，饮用过多的可乐、有色饮料等，都导致了畸形精子率的升高。
四、某些药物的影响：如很多糖皮质激素，抗肿瘤药物如环磷酰胺、细胞代谢药物长春新碱等，某些抗生素等都可导致精子畸形比例的增高。
五、遗传因素：如某些疾病纤毛不动综合征、Y染色体微缺失、常染色体结构和数目异常、包括易位和倒位等等，这些患者可以表现为精子畸形率高与弱精、少精子甚至无精子同时存在。
如果被诊断为精子畸形率过高，该如何预防和治疗呢？
首先，要端正心态，不要被精子畸形率吓倒。怀孕生育是大自然给予人类的最伟大的权利和幸福之一，“自然选择，优胜劣汰”，只要不是100％的都是精子畸形，那么，就有正常精子受孕的可能，当然，精子的畸形率越高，成功受孕和生育的质量，从理论上推测，可能越有保障。
其次是一般治疗，忌烟，少喝点酒（最好戒酒），远离辐射，远离各种有害的化学物质，不要洗桑拿，不要长期穿紧身内裤（洗桑拿或长期穿紧身内裤会使局部温度升高，抑制生精）。远离雾霾，不要吸入汽车尾气，不喝可乐，不过多饮用有色饮料等等，加强锻炼，平衡膳食，做到这一些，才是积淀了改善和治疗畸形精子症的基础。
再次是病因治疗和抗氧化及营养治疗。包括必要时做精索静脉高位结扎手术，用抗生素控制附睾炎、尿道炎及前列腺炎等。服用维生素C、叶酸、谷胱甘肽等抗氧化剂，必要时加用辅酶Q10、精氨酸等营养性物质。
最后，可以考虑辅助生殖技术，如果按照WHO第四版工作手册，畸形率在95％以上，经多次复查，且经多方治疗无效的，而女方年龄太大者，可以考虑试管婴儿助孕。单精子注射技术ICSI使得能挑选单个相对正常的精子进行卵子细胞浆内显微注射，从而受孕。
