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曾经有权威研究室表明公用的马桶是不会传染性病的。但是这个问题在北京某医院的专家表示，此问题多年以来一直存在不少争议。而实际上通过马桶传染性病的案例一直都又发生。
科学研究室调查表示：性病传播85%是通过紧密的性接触，血液传染，母体传染给婴儿也是有案例时常发生的。其中介质传播是一个很重要的途径，在医学教科书上就一直有通过洗浴或座便器传播梅毒的病例。
从生活中的一些小细节便可发现人们对此问题的关注程度，在公用的卫生间外面总有人排队等候蹲便器而拒绝使用坐便器。还有人见到商场饭店里的座便器就发怵，正琢磨着如何既解了内急又不和座垫"亲密接触"，却发现早有前人在上面踩出两个黑脚印--将座式改为蹲式。
害怕被传染疾病是人们共有的担心。李主任解释说，性病的病菌附着在皮肤的皮屑上，如果性病患者接触了马桶，皮屑就可能脱落，沾在马桶表面，而下一个人直接接触了马桶，就会因此传染上性病。更为关键的是，这些病菌有较长的存活时间，淋病细菌能活24小时，性病病毒更长，为2~3天。而现在发病率呈明显上升趋势的疱疹，因为不光出现在生殖器上，同样存在于臀部，所以与座便器的接触面更大。
在高于人体正常体温和存在百分之八十的湿度情况下，这些性病的病菌体便会死亡。公共场所，如果保证消毒清洗，就不会有问题。当然，自我保护的意识也是要有的。
手部有细菌体就很可能会传染到身体其他部位，因为饭前便后需要洗手不是没有道理的。若用被污染的手揉眼睛，那么手部的病菌体就会迅速传染到眼睛里。另外，可以在上公共厕所时用纸巾将垫圈擦拭一下，具有消毒功能的湿纸巾更好。还要注意在公共卫生间不要到处乱摸，保证手部清洁。如果条件允许，可以使用一次性的马桶垫圈。
