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细菌与人类的关系具有双重性，既有致病菌危害健康，也有益生菌维持生态平衡。对人类有害的细菌主要包括金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、沙门氏菌等；而对人类有益的细菌有双歧杆菌、乳酸菌、酵母菌等。
金黄色葡萄球菌可引起皮肤化脓感染、食物中毒甚至败血症；大肠杆菌某些致病株会导致腹泻、尿路感染；沙门氏菌污染食物后引发急性胃肠炎。这些病原体通过破坏组织、释放毒素或激发过度免疫反应损害人体。
如白色念珠菌、绿脓杆菌等在免疫力正常时不致病，但当机体抵抗力下降时可能引发机会性感染。长期使用抗生素、免疫抑制剂或患有慢性疾病者需特别注意防范。
肠道中的双歧杆菌能抑制有害菌繁殖，促进营养吸收；乳酸菌可调节肠道菌群平衡，增强免疫功能；酵母菌有助于维生素B族合成。这些微生物与人体形成互利共生关系。
枯草芽孢杆菌用于污水处理，曲霉菌参与酱油酿造，醋酸菌帮助食醋发酵。这些菌种在食品加工、环境保护等领域发挥重要作用，其代谢产物广泛应用于日常生活。
链霉菌产生链霉素等抗生素，苏云金芽孢杆菌制成生物农药，部分基因改造菌用于胰岛素生产。微生物制药已成为现代医学的重要支柱。
保持与细菌的良性互动需要科学认知：日常注意饮食卫生避免致病菌感染，适当补充含益生菌的发酵食品维护肠道健康；使用抗生素时遵医嘱避免菌群失调；接触自然环境有助于维持人体菌群多样性。合理利用有益菌资源，严格防控病原菌传播，才能实现人类与微生物的和谐共存。
