有许多病原体可以感染前列腺,诱发前列腺炎。常见的病原体包括细菌、真菌、支原体、衣原体、放线菌、寄生虫以及病毒等,其中以细菌感染最为常见,细菌感染是细菌性前列腺炎的病因。细菌可以单独感染,也可以与两种以上的细菌混合感染。一种或多种细菌与真菌、支原体或衣原体混合感染的情况是比较常见的。人体乳头瘤病毒、单纯疱疹病毒ⅱ型和人类巨细胞病毒与慢性前列腺炎有密切关系。阴道毛滴虫是引起前列腺炎较为常见的病原体之一。包虫、丝虫或阿米巴原虫感染引起的前列腺炎也有报道。放线菌可以引起前列腺的慢性感染,主要是由于内源性感染所致。克雷白菌以及假单胞菌属等也可成为慢性细菌性前列腺炎的致病菌。
革兰阳性细菌是前列腺液细菌培养中较常发现的微生物,并有报道其作为明显致病菌的病例,尤其是对部分培养仅为革兰阳性菌(不包括肠球菌)的患者进一步研究表明可重复发作慢性细菌性前列腺炎,且这些病原菌能够引起泌尿系统感染,这是革兰阳性细菌引起慢性前列腺炎的一个显著特点。但革兰阳性细菌是否可以引起前列腺炎还存在争议,多数学者认为类肠球菌可以引起慢性前列腺炎,并与复发性肠球菌尿有关,而其他革兰阳性细菌在前列腺炎中的病因作用,如凝固酶阴性的葡萄球菌、链球菌、细球菌、类白喉杆菌尚不确定。这种革兰阳性细菌普遍存在于正常的皮肤黏膜,主要存在于正常男性的前尿道,一般认为它们是共生细菌,而非致病菌。